MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_1

Total Repeats: 2990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013365	TGA	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752013
2	NC_013365	TG	3	6	362	367	0 %	50 %	50 %	0 %	260752013
3	NC_013365	AGG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752013
4	NC_013365	TTTC	2	8	446	453	0 %	75 %	0 %	25 %	260752013
5	NC_013365	TGAT	2	8	506	513	25 %	50 %	25 %	0 %	260752013
6	NC_013365	AAG	2	6	517	522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752013
7	NC_013365	TGG	2	6	536	541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752013
8	NC_013365	CTTA	2	8	585	592	25 %	50 %	0 %	25 %	260752013
9	NC_013365	A	6	6	619	624	100 %	0 %	0 %	0 %	260752013
10	NC_013365	GCA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752013
11	NC_013365	AT	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	260752013
12	NC_013365	TGCC	2	8	662	669	0 %	25 %	25 %	50 %	260752013
13	NC_013365	GAC	2	6	717	722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752013
14	NC_013365	ATC	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752013
15	NC_013365	AAG	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752013
16	NC_013365	ACTAC	2	10	1129	1138	40 %	20 %	0 %	40 %	260752014
17	NC_013365	ATAAC	2	10	1293	1302	60 %	20 %	0 %	20 %	260752014
18	NC_013365	ATA	2	6	1309	1314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752014
19	NC_013365	A	6	6	1375	1380	100 %	0 %	0 %	0 %	260752014
20	NC_013365	GGC	2	6	1412	1417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752014
21	NC_013365	GGC	2	6	1455	1460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752014
22	NC_013365	A	6	6	1477	1482	100 %	0 %	0 %	0 %	260752014
23	NC_013365	TGC	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752014
24	NC_013365	TGAA	2	8	1619	1626	50 %	25 %	25 %	0 %	260752014
25	NC_013365	TTGG	2	8	1647	1654	0 %	50 %	50 %	0 %	260752014
26	NC_013365	ATGA	2	8	1666	1673	50 %	25 %	25 %	0 %	260752014
27	NC_013365	TTTG	2	8	1690	1697	0 %	75 %	25 %	0 %	260752014
28	NC_013365	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752015
29	NC_013365	ATC	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752015
30	NC_013365	TGT	2	6	2447	2452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752015
31	NC_013365	AACCT	2	10	2480	2489	40 %	20 %	0 %	40 %	260752015
32	NC_013365	ATG	2	6	2515	2520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752015
33	NC_013365	A	6	6	2540	2545	100 %	0 %	0 %	0 %	260752015
34	NC_013365	CATA	2	8	2662	2669	50 %	25 %	0 %	25 %	260752016
35	NC_013365	AATA	2	8	2685	2692	75 %	25 %	0 %	0 %	260752016
36	NC_013365	ATTCT	2	10	2704	2713	20 %	60 %	0 %	20 %	260752016
37	NC_013365	GGT	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752016
38	NC_013365	AGC	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752016
39	NC_013365	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752016
40	NC_013365	T	6	6	2881	2886	0 %	100 %	0 %	0 %	260752016
41	NC_013365	TAG	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752016
42	NC_013365	CAG	2	6	2975	2980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752017
43	NC_013365	CATT	2	8	2992	2999	25 %	50 %	0 %	25 %	260752017
44	NC_013365	AGG	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752017
45	NC_013365	GAA	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752017
46	NC_013365	CGA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752017
47	NC_013365	ATT	2	6	3195	3200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752017
48	NC_013365	A	6	6	3215	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	260752017
49	NC_013365	GAA	2	6	3270	3275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752017
50	NC_013365	GTT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752017
51	NC_013365	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752017
52	NC_013365	ACA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752017
53	NC_013365	CAG	2	6	3441	3446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752017
54	NC_013365	GTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752017
55	NC_013365	CGAT	2	8	3493	3500	25 %	25 %	25 %	25 %	260752017
56	NC_013365	ATC	2	6	3584	3589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752017
57	NC_013365	GAC	2	6	3628	3633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752017
58	NC_013365	AAC	2	6	3703	3708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752017
59	NC_013365	CCG	3	9	3726	3734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260752017
60	NC_013365	A	6	6	3760	3765	100 %	0 %	0 %	0 %	260752018
61	NC_013365	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752018
62	NC_013365	AAT	2	6	3857	3862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752018
63	NC_013365	CAA	2	6	3957	3962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752018
64	NC_013365	CAG	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752018
65	NC_013365	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752018
66	NC_013365	AAG	2	6	4200	4205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752018
67	NC_013365	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752018
68	NC_013365	TGA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752018
69	NC_013365	CAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752018
70	NC_013365	AGA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752018
71	NC_013365	AAC	2	6	4477	4482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752018
72	NC_013365	ATG	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752018
73	NC_013365	AGA	2	6	4567	4572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752018
74	NC_013365	TTG	2	6	4625	4630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752018
75	NC_013365	AAG	2	6	4674	4679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752018
76	NC_013365	TGG	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752018
77	NC_013365	ATT	2	6	4927	4932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752018
78	NC_013365	TAC	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752018
79	NC_013365	ATA	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752018
80	NC_013365	TTA	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752019
81	NC_013365	AT	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	260752019
82	NC_013365	TGA	2	6	5126	5131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752019
83	NC_013365	TTG	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752019
84	NC_013365	GTCG	2	8	5208	5215	0 %	25 %	50 %	25 %	260752019
85	NC_013365	TAA	2	6	5230	5235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752019
86	NC_013365	AAT	2	6	5253	5258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752019
87	NC_013365	ATG	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752019
88	NC_013365	TAA	2	6	5411	5416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752019
89	NC_013365	TGC	2	6	5469	5474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752020
90	NC_013365	ATTG	2	8	5484	5491	25 %	50 %	25 %	0 %	260752020
91	NC_013365	TCA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752020
92	NC_013365	TCAA	2	8	5502	5509	50 %	25 %	0 %	25 %	260752020
93	NC_013365	A	6	6	5527	5532	100 %	0 %	0 %	0 %	260752020
94	NC_013365	GAA	2	6	5535	5540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752020
95	NC_013365	A	6	6	5548	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	260752020
96	NC_013365	TGA	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752020
97	NC_013365	AGA	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752020
98	NC_013365	CAA	2	6	5823	5828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752020
99	NC_013365	AG	3	6	6019	6024	50 %	0 %	50 %	0 %	260752020
100	NC_013365	GTT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752020
101	NC_013365	TTC	2	6	6137	6142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260752020
102	NC_013365	ATT	2	6	6154	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752020
103	NC_013365	A	6	6	6241	6246	100 %	0 %	0 %	0 %	260752020
104	NC_013365	CAT	3	9	6249	6257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752020
105	NC_013365	CTG	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752020
106	NC_013365	GCGT	2	8	6330	6337	0 %	25 %	50 %	25 %	260752020
107	NC_013365	GT	3	6	6360	6365	0 %	50 %	50 %	0 %	260752020
108	NC_013365	GAAATG	2	12	6461	6472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260752020
109	NC_013365	AGG	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752020
110	NC_013365	G	7	7	6633	6639	0 %	0 %	100 %	0 %	260752020
111	NC_013365	ACT	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752020
112	NC_013365	AGC	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752020
113	NC_013365	AAC	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752021
114	NC_013365	A	6	6	6812	6817	100 %	0 %	0 %	0 %	260752021
115	NC_013365	GAGT	2	8	6818	6825	25 %	25 %	50 %	0 %	260752021
116	NC_013365	CTG	2	6	6826	6831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752021
117	NC_013365	TAC	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752021
118	NC_013365	A	6	6	6882	6887	100 %	0 %	0 %	0 %	260752021
119	NC_013365	TAA	2	6	7067	7072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752021
120	NC_013365	GCA	2	6	7094	7099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752021
121	NC_013365	AACT	2	8	7106	7113	50 %	25 %	0 %	25 %	260752021
122	NC_013365	ATT	2	6	7120	7125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752021
123	NC_013365	TGG	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752021
124	NC_013365	AAAG	2	8	7275	7282	75 %	0 %	25 %	0 %	260752021
125	NC_013365	AAG	2	6	7414	7419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752022
126	NC_013365	GACG	2	8	7557	7564	25 %	0 %	50 %	25 %	260752022
127	NC_013365	G	7	7	7577	7583	0 %	0 %	100 %	0 %	260752022
128	NC_013365	TTC	2	6	7597	7602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260752022
129	NC_013365	TTA	2	6	7648	7653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752022
130	NC_013365	GAC	2	6	7659	7664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752022
131	NC_013365	TTA	2	6	7738	7743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752022
132	NC_013365	TAA	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752022
133	NC_013365	ATG	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752022
134	NC_013365	TCCCC	2	10	7825	7834	0 %	20 %	0 %	80 %	260752022
135	NC_013365	TAA	2	6	7925	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752022
136	NC_013365	AGA	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752022
137	NC_013365	GCTG	2	8	8009	8016	0 %	25 %	50 %	25 %	260752022
138	NC_013365	AATGA	2	10	8157	8166	60 %	20 %	20 %	0 %	260752023
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261	NC_013365	ACGA	2	8	17292	17299	50 %	0 %	25 %	25 %	260752029
262	NC_013365	TAA	2	6	17357	17362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752029
263	NC_013365	TCC	2	6	17376	17381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260752029
264	NC_013365	T	6	6	17405	17410	0 %	100 %	0 %	0 %	260752029
265	NC_013365	TTG	2	6	17465	17470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752029
266	NC_013365	T	6	6	17498	17503	0 %	100 %	0 %	0 %	260752029
267	NC_013365	T	6	6	17537	17542	0 %	100 %	0 %	0 %	260752029
268	NC_013365	TCA	2	6	17658	17663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752029
269	NC_013365	T	6	6	17694	17699	0 %	100 %	0 %	0 %	260752029
270	NC_013365	ATG	2	6	17703	17708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752029
271	NC_013365	CAA	2	6	17824	17829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752029
272	NC_013365	GCA	2	6	17853	17858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752029
273	NC_013365	TAA	2	6	17863	17868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752029
274	NC_013365	GAC	2	6	17907	17912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752029
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276	NC_013365	TAT	3	9	18018	18026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752030
277	NC_013365	GTG	2	6	18045	18050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752030
278	NC_013365	TG	3	6	18059	18064	0 %	50 %	50 %	0 %	260752030
279	NC_013365	TGG	2	6	18092	18097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752030
280	NC_013365	GTA	2	6	18155	18160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752030
281	NC_013365	AGT	2	6	18179	18184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752030
282	NC_013365	TAC	2	6	18316	18321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752030
283	NC_013365	GAG	2	6	18418	18423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752030
284	NC_013365	TTG	2	6	18437	18442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752030
285	NC_013365	TCA	2	6	18513	18518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752030
286	NC_013365	CGCC	2	8	18593	18600	0 %	0 %	25 %	75 %	260752030
287	NC_013365	CAC	2	6	18608	18613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260752030
288	NC_013365	ATA	2	6	18637	18642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752030
289	NC_013365	TTTA	2	8	18655	18662	25 %	75 %	0 %	0 %	260752030
290	NC_013365	TCT	2	6	18686	18691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260752030
291	NC_013365	AC	3	6	18711	18716	50 %	0 %	0 %	50 %	260752030
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294	NC_013365	AGAA	2	8	18887	18894	75 %	0 %	25 %	0 %	260752030
295	NC_013365	TGGCTG	2	12	19347	19358	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260752031
296	NC_013365	GTT	2	6	19391	19396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752031
297	NC_013365	TGA	2	6	19399	19404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752031
298	NC_013365	GTA	2	6	19407	19412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752031
299	NC_013365	CAC	2	6	19556	19561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260752031
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302	NC_013365	AAT	2	6	19730	19735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752031
303	NC_013365	A	7	7	19750	19756	100 %	0 %	0 %	0 %	260752031
304	NC_013365	TGA	2	6	19764	19769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752031
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306	NC_013365	TGA	2	6	19864	19869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752031
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323	NC_013365	T	6	6	20643	20648	0 %	100 %	0 %	0 %	260752032
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363	NC_013365	CCAC	2	8	25730	25737	25 %	0 %	0 %	75 %	260752036
364	NC_013365	TTCC	2	8	25895	25902	0 %	50 %	0 %	50 %	260752036
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373	NC_013365	T	6	6	26132	26137	0 %	100 %	0 %	0 %	260752036
374	NC_013365	GCG	2	6	26201	26206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752037
375	NC_013365	CCA	2	6	26265	26270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260752037
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378	NC_013365	ATAC	2	8	29091	29098	50 %	25 %	0 %	25 %	260752038
379	NC_013365	AAG	2	6	29101	29106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752038
380	NC_013365	T	8	8	29174	29181	0 %	100 %	0 %	0 %	260752038
381	NC_013365	CTG	2	6	29225	29230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752038
382	NC_013365	GATC	2	8	29241	29248	25 %	25 %	25 %	25 %	260752038
383	NC_013365	TTA	2	6	29333	29338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752038
384	NC_013365	CGG	2	6	29355	29360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752038
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386	NC_013365	CCT	2	6	29622	29627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260752039
387	NC_013365	TGA	2	6	29689	29694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752039
388	NC_013365	GCAAG	2	10	29699	29708	40 %	0 %	40 %	20 %	260752039
389	NC_013365	GAA	2	6	29821	29826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752039
390	NC_013365	TCAG	2	8	29838	29845	25 %	25 %	25 %	25 %	260752039
391	NC_013365	CAAA	2	8	29846	29853	75 %	0 %	0 %	25 %	260752039
392	NC_013365	GCAG	2	8	29890	29897	25 %	0 %	50 %	25 %	260752039
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